Nie ma możliwości całkowitego uchronienia się przed bakteriami, gdyż są one wszechobecne. Trzeba jednak pamiętać o tym, że podstawową tarczą ochronną przed wszelkimi chorobotwórczymi drobnoustrojami jest system immunologiczny. Jeśli ma się silny układ odpornościowy, poradzi sobie on samodzielnie z inwazją patogenów. Nawet jeśli dojdzie do ich przeniknięcia w głąb organizmu, rozpocznie się wewnętrzna walka, wzmożona produkcja przeciwciał i uruchomienie szeregu mechanizmów obronnych. Przy mniej sprawnym układzie odpornościowym konieczne może okazać się zastosowanie antybiotyków i leków pomocniczych. Problem pojawia się w przypadku super bakterii, na które nie działają żadne medykamenty.